但是，滚筒干燥机也有其缺点，主要有：由于滚筒的表面湿度较高，因而对一些制品会因过热而有损风味或呈不正常的颜色。另外，若使用真空干燥器，成本较高，仅适用于热敏性非常高的物料的处理。

滚筒干燥机在干燥物料时干燥时间短，一般约为7-30s，干燥的产品没有处于高温的危险，适用于热敏性物料的干燥，但壁面也有可能产生过热；不管干燥的物料浆液粘度高或低均能对其进行干燥；热效率高；因干燥机内不会剩残留产品，少量物料也可以干燥；滚筒干燥机的操作参数调整范围广，并易于调整。